エアダスターのガスはフロン系かジメチルエーテルなので、何かが残るということはたぶん無いと思います。

逆にブロワーの方は外気を吸って吹くわけですから、空気中の微細な埃などはそのまま吹きかける事になります。
不純物を入れたくない場合はエアダスターの方が良いかもしれません。
もっと厳密に不純物を取り除くならガスフィルターなどを通すしかないですね。

>フロン系かジメチルエーテル
確かに、機械なんかに吹き付ける分には良いのでしょうが、使いたいのが水溶液系なのでこの辺の水への溶解度によっては溶液中に残存しそうかなぁと…。
埃は怖いですがこの辺が入らないように工夫ができればブロワーのほうが良いのかなと愚考。
両方試してみるのが一番でしょうか。

何か特殊な用途に使うのですね…。
http://www.questions.gr.jp/chem/odoroki2.htm
このあたりを見た感じではフロン系は溶解度は低いみたいです。
有機合成などで酸素を除きたいなら風船にアルゴンを入れると使いやすいです。
アルゴンラインにその辺で売ってる風船を付けてシューッと。
風船の口に注射針をセットする工夫をするともっと便利に！

私もカメラ用に持ってますね。
カメラ内部にエアダスターを吹いたら、大変な事になりそうです。
これなら、適度な風圧に調整出来ますし！
無知だった為、先に付ける鹿毛？でデジタル一眼レフのミラーを擦ってしまい、大変な目にあいましたｗｗｗ

エアダスターは液化ガスですから、急激な温度変化で曇ってしまうかも…。
このブラシの正しい用途はよく分かりませんが、
吹きながらブラシで掃くと静電気でくっついた埃が飛びやすくなるような気がします！
カメラは埃とか曇りとか扱いが大変そうですね。